论文打了脚注学术查重会查的情况下，一般来说学术查重系统会检测到脚注的内容，并将其计入查重结果中。因此，打了脚注的论文在学术查重时可能会受到影响。为避免学术查重的影响，建议在撰写论文时注意脚注的使用。可以尝试将脚注内容进行适当调整，避免与正文内容重复，或者尝试将脚注部分进行特殊处理，以减少查重时的干扰。

另外，为了避免学术查重时脚注的干扰，还可以尝试在提交论文前进行反复检查和修改，确保脚注的内容与正文内容不重复，避免引起查重系统的误判。同时，也可以尝试在脚注部分添加一些个人的见解或分析，以增加论文的独特性，减少与其他文献的重复性，从而提高通过查重的几率。综上所述，论文打了脚注学术查重会查，但可以通过一定的方法和技巧来避免查重结果受到脚注的影响。